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Zwayer foi suspenso por seis meses em 2005 devido ao seu envolvimento num escândalo de manipulação de resultados.
O alemão Zwayer, de 43 anos, recebeu a suspensão da DFB, a Federação Alemã de Futebol, depois de ter trabalhado como auxiliar de Robert Hoyzer, que foi condenado por aceitar subornos para manipular vários jogos da segunda divisão que dirigiu.
Supostamente, Zwayer aceitou um suborno de 300 euros antes de um jogo do Wuppertaler SV, mas mais tarde redimiu-se ligeiramente ao informar a Federação Alemã de Futebol sobre a manipulação de resultados de Hoyzer, sendo apoiado por outros três árbitros.
Só em 2014, quando a publicação alemã Die Zeit divulgou “O Dossier Zwayer”, é que o público alemão tomou conhecimento da suspensão de Zwayer. Entretanto, Hoyzer foi banido do futebol para sempre.
O regresso de Zwayer à arbitragem em 2021 levou Jude Bellingham a criticar a sua autorização para arbitrar jogos da Bundesliga e a sua atuação no duelo entre o Borussia Dortmund e o Bayern Munique, em dezembro desse ano, afirmando: “Dão a um árbitro que já manipulou jogos o maior encontro da Alemanha, o que esperam?”
Passaram apenas cinco dias desde que Zwayer esteve ao comando de outro jogo decisivo em solo dinamarquês, quando o Midtjylland defrontou o Nottingham Forest na Liga Europa.