O clube paulista enfrentou o emblema colombiano na noite de quarta-feira nesta cidade turística porque o seu estádio, na vizinha Barranquilla, está em obras.
Vídeos divulgados nas redes sociais mostram confrontos entre adeptos do Junior e do clube local Real Cartagena após a partida da primeira jornada da fase de grupos, que terminou 1-1. Um dos registos mostra um homem a esfaquear outro que está caído no chão.
Um responsável da polícia de Cartagena afirmou à imprensa que a vítima, um adepto do Junior, teve "vários ferimentos" causados por uma arma branca.
Não há indícios de que adeptos do Palmeiras tenham participado nos distúrbios.
O futebol colombiano acumula episódios recorrentes de violência nos estádios e arredores. Em janeiro deste ano, outro confronto entre adeptos deixou um morto na cidade de Cúcuta, na fronteira com a Venezuela.
Pelo menos 150 adeptos foram assassinados desde 2008, segundo investigações independentes diante da falta de números oficiais.